Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CLN8Q9UBY8 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CLN8Q9UBY8 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms