Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSD3Q9NYI0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms