Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KLHL28Q9NXS3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms