Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RHBDL2Q9NX52 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms