Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CARD11Q9BXL7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms