Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MALSU1Q96EH3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms