Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UTP4Q969X6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms