Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HGDQ93099 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms