Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PALLDQ8WX93 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms