Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHDC4Q8TBB5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KLHDC4Q8TBB5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms