Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HJURPQ8NCD3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms