Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms