Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6D2

RNF182, E3 ubiquitin-protein ligase RNF182, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF182Q8N6D2 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RNF182Q8N6D2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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