Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PLD3Q8IV08 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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PLD3Q8IV08 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PLD3Q8IV08 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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