Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC1

PP13850, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q71RC1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Q71RC1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Q71RC1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Q71RC1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms