Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC149Q6ZUS6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms