Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC102BQ68D86 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC102BQ68D86 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms