Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms