Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TDRD12Q587J7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms