Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM16LQ309B1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms