Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TNXAQ16473 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms