Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNCBQ16143 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SNCBQ16143 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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