Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
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NEDD8Q15843 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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NEDD8Q15843 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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NEDD8Q15843 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NEDD8Q15843 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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NEDD8Q15843 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NEDD8Q15843 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NEDD8Q15843 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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NEDD8Q15843 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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NEDD8Q15843 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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NEDD8Q15843 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NEDD8Q15843 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms