Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NCOA1Q15788 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
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