Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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