Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CACNA1CQ13936 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CACNA1CQ13936 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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