Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATP1A4Q13733 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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