Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL4BQ13620 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL4BQ13620 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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