Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
C1orf61Q13536 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms