Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPP1R1AQ13522 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPP1R1AQ13522 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPP1R1AQ13522 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PPP1R1AQ13522 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PPP1R1AQ13522 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms