Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTK7Q13308 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PTK7Q13308 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms