Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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RPA4Q13156 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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RPA4Q13156 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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RPA4Q13156 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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RPA4Q13156 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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RPA4Q13156 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RPA4Q13156 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
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