Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
BNIP1Q12981 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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