Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PTP4A2Q12974 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTP4A2Q12974 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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PTP4A2Q12974 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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PTP4A2Q12974 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
PTP4A2Q12974 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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