Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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