Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BPTFQ12830 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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