Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM27E3Q08E93 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms