Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RAD51Q06609 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RAD51Q06609 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms