Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABPB1Q06547 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABPB1Q06547 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms