Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A11Q02978 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms