Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
XPCQ01831 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
XPCQ01831 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
XPCQ01831 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
XPCQ01831 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms