Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H3F3AP84243 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H3F3AP84243 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms