Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TPTEP56180 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TPTEP56180 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TPTEP56180 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
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