Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP4P49662 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP4P49662 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CASP4P49662 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CASP4P49662 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CASP4P49662 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP4P49662 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP4P49662 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP4P49662 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CASP4P49662 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms