Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMPOP42166 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMPOP42166 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms