Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PGM1P36871 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PGM1P36871 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PGM1P36871 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PGM1P36871 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PGM1P36871 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms