Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP5C1P36542 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATP5C1P36542 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms