Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 VPS9D1-203ENST00000563798 459 ntTSL 319.35■□□□□ 0.692e-6■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-6■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-6■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-6■■■□□ 18.3
GTF2F1P35269 BCAR1-218ENST00000566982 3024 ntTSL 217.84■□□□□ 0.456e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 SLC7A6-215ENST00000568088 510 ntTSL 329.12■■■□□ 2.257e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 SLC7A6-208ENST00000564708 547 ntTSL 324.28■■□□□ 1.487e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 SLC7A6-211ENST00000566834 573 ntTSL 59.92□□□□□ -0.827e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PLEKHA1-208ENST00000494222 603 ntTSL 322.48■■□□□ 1.191e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.481e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.271e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 322.92■■□□□ 1.262e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.112e-8■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.042e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.012e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.892e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 FDPS-212ENST00000487002 2017 ntTSL 219.5■□□□□ 0.716e-8■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 FDPS-205ENST00000465559 677 ntTSL 316.82■□□□□ 0.286e-8■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 FDPS-210ENST00000474345 713 ntTSL 316.37■□□□□ 0.216e-8■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.985e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.818e-11■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PFN1-202ENST00000572383 539 ntTSL 319.63■□□□□ 0.738e-11■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 DLGAP4-AS1-201ENST00000425233 443 ntTSL 517.34■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.434e-9■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.434e-9■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 C17orf99-205ENST00000586999 379 ntTSL 216.17■□□□□ 0.181e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.164e-9■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 SLC38A5-209ENST00000497336 493 ntTSL 515.66■□□□□ 0.14e-9■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 SLC38A5-210ENST00000595796 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.14e-9■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 C17orf99-206ENST00000591995 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 414.08□□□□□ -0.161e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 SLC38A5-206ENST00000480105 894 ntTSL 213.67□□□□□ -0.224e-9■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 C17orf99-201ENST00000340363 984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.451e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.327e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-203ENST00000439080 1388 ntTSL 218.22■□□□□ 0.517e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-231ENST00000639599 1283 ntTSL 516.59■□□□□ 0.257e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.217e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-202ENST00000315091 1835 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.217e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-221ENST00000619555 682 ntTSL 512.67□□□□□ -0.387e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-226ENST00000621790 1008 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.477e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-229ENST00000638264 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.477e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-217ENST00000616545 920 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.477e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-230ENST00000639083 2269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.57e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-223ENST00000620632 706 ntTSL 311.75□□□□□ -0.537e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-206ENST00000473869 1946 ntTSL 511.52□□□□□ -0.577e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-211ENST00000610369 563 ntTSL 510.8□□□□□ -0.687e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-218ENST00000617172 980 ntTSL 510.8□□□□□ -0.687e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-227ENST00000622057 706 ntTSL 510.61□□□□□ -0.717e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-222ENST00000620505 657 ntTSL 510□□□□□ -0.817e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 AL109811.4-201ENST00000614757 1793 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.837e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-213ENST00000611963 739 ntTSL 58.47□□□□□ -1.057e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-216ENST00000614494 515 ntTSL 58.1□□□□□ -1.117e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TARDBP-208ENST00000477447 409 ntTSL 55.24□□□□□ -1.577e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 AL109811.4-203ENST00000612542 554 ntAPPRIS P1 TSL 55.24□□□□□ -1.577e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 AL109811.4-202ENST00000611136 700 ntTSL 54.78□□□□□ -1.647e-26■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 ANKRD40-202ENST00000507114 567 ntTSL 218.64■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TEAD4-207ENST00000543035 801 ntTSL 528.98■■■□□ 2.237e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TEAD4-206ENST00000540314 578 ntTSL 419.9■□□□□ 0.787e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.687e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TEAD4-205ENST00000536826 570 ntTSL 418.43■□□□□ 0.547e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.467e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.257e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 TEAD4-204ENST00000443986 641 ntTSL 314.72□□□□□ -0.057e-7■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 NPAS2-202ENST00000427413 625 ntTSL 38.18□□□□□ -1.11e-6■■■□□ 18.2
GTF2F1P35269 PFKL-203ENST00000460020 890 ntTSL 524.93■■□□□ 1.582e-8■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 PFKL-209ENST00000495274 951 ntTSL 217.68■□□□□ 0.422e-8■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-217ENST00000536340 5273 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.559e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-220ENST00000617418 3411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.569e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-205ENST00000360911 4991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.579e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-202ENST00000311275 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.583e-8■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-204ENST00000355972 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.69e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-218ENST00000540497 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.669e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.789e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-213ENST00000461685 3567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.819e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-212ENST00000458360 3729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.819e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-207ENST00000396281 5511 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.869e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.879e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-219ENST00000611941 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.929e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.949e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.949e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-211ENST00000446994 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.949e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.029e-7■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.271e-30■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 RFLNA-203ENST00000389727 2385 ntAPPRIS P2 TSL 522.19■■□□□ 1.141e-30■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-30■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-30■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 RFLNA-204ENST00000545615 449 ntTSL 312.93□□□□□ -0.341e-30■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.421e-30■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 227.74■■■□□ 2.035e-9■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.015e-9■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 MANF-201ENST00000446668 846 ntTSL 323.07■■□□□ 1.285e-9■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.555e-9■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.135e-9■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.035e-9■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 SNHG14-211ENST00000547292 626 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.555e-9■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 HECTD1-217ENST00000557369 554 ntTSL 45.65□□□□□ -1.55e-9■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 HECTD1-204ENST00000553957 4395 ntTSL 25.37□□□□□ -1.555e-9■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 EIF4A1-206ENST00000577929 696 ntTSL 221.43■■□□□ 1.021e-12■■■□□ 18.1
GTF2F1P35269 EIF4A1-217ENST00000581384 642 ntTSL 510.43□□□□□ -0.741e-12■■■□□ 18.1
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 168.8 ms