Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SFTPDP35247 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms