Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PCGF2P35227 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCGF2P35227 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms